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NPOバードリサーチ の研究支援募集に採択されました。どうぞご支援ください。

NPOバードリサーチ の研究支援募集に採択されました。どうぞご支援ください。 内容は「鳥の鳴き声のテープ起こしを楽にするWEBアプリ(トリル)の開発」です。有志でボランタリベースで行います。多分ユーザは国内で2桁、世界でも3桁もいないでしょうが、手作業の度合いを下げ効率化することで環境保全と生態調査のお役に立ちたい。 また、鳴き声自動認識のための教師データの収集も兼ねられるアプリなので集まったデータの公開でアルゴリズムの改良に役立てます。 詳しくはリンクをご覧ください。 一口三千円からです。他にも魅力的な調査もあります。この活動全体へのご支援、大歓迎です。 http://www.bird-research.jp/1_event/aid/kifu.html http://www.bird-research.jp/1_event/…/plan/BR-aid2019009.pdf

ICレコーダの覚書(OLYMPUS LS-7)

最近、タイマー録音機能付きのICレコーダ(ICR)の選択肢の幅が狭まっています。そのため、昔のICRを漁ることになるのですが、今回友人に教えてもらったLS-7を初入手。 使いこなしのための覚書です。 ファイルの作成時間:録音修了時間です。録音開始時間ではないです。この仕様は非常に好ましい。 確認方法:ICR(LS-7)で録音します。REC(pause)→REC(録音開始)→STOPで録音します。それぞれの時刻を秒単位まで記録しておきます。 terminal/OSXで  ls --full-time *   で確認すると時間が出てきます。 マイクは90度のステレオ+センターの3つ内蔵ですが、野鳥録音には次の設定が自然に感じました。 センターマイク=オフ 指向性=オフ ファイル名(8.3):ファイル日付がない。 LS_70039.WAV

マイクロフォンアレーを自作するのだ

鳥の声は聞けば大抵どちらの方向から鳴いたかわかると思う。 でも、わかりにくい鳥もいる。 その代表がトラツグミだ。夜中、沢沿いの森の中で聞いていると本当にどちらから鳴いているのかわからない場所がある。わかる場所もある。こだまのせいなのか、思い込みなのか。強弱がついて聞こえるその声は移動すているのかどうかもわからなくなる。 というわけで方位検知をロボット聴覚技術を応用して測っちゃいましょう作戦を立案中。そのため、フィールドで使えて安価なマイクアレーを見つけられなかったので、自作することにした。 その製作記ではなく、録音機材の話。 ZOOM H6は6チャネル入力なのだけど、標準構成はステレオマイクなので、これを標準プラグを6チャネル入力にするためのヘッドを購入することにした。 注意はファントム電源非対応なので、コンデンサマイクをつなぐなら電源を別に用意しなければならないこと。マイクアレーはWM61互換のマイクカプセルに006Pで給電させる電源箱も自作する予定。 プリンタもついでに買わないとなー。

鳩ヶ湯(越前大野)にて

山鳩が傷を癒したという謂れのある鳩ヶ湯に行って来ました。 大野市街から車でおおよそ30〜40分の白山国立公園にあります。標高560mと携帯電話のGPSソフトは教えてくれます。 そこにアオバトが湧き出る鉱泉水を飲みに来ます。また同じ名前の日帰り入浴もできる旅館(鳩ヶ湯)が1件営業しており、アオバトがどこで観れるか尋ねるとすぐ教えてもらえました。すぐ脇の橋の上から対岸に薄く褐色になった法面が見えます。その辺りで水を飲みに来るとのこと。コンクリを打った法面の上に土の斜面から流れ出た湧き水が溜まっているように見えます。よく見るとWEBカメラも設置していあります(自然保護センターが設置したようです) 打波川は透明で水量も多く、魚を追う人にも人気がありそう。橋で見ているとアオバトが3〜4羽から20+羽の群れで山の間を行き来します。照ヶ崎(大磯)の海外に降り立つアオバトの群れとは違って、すぐに湧き水を飲みに降りるのではなく、一旦湧く場所(ミネラルサイトと呼ぶとすると)の上の木立に入ります。群れが止まるのは広葉樹の樹冠から少し下の葉陰だけでなく、枯れ木の先端だったり、杉の先端だったり見えるところにも止まります。 安全を確認できたと思うのか、アオバトが少数でジグザグに降りていき、ミネラルサイトで嘴をつけて吸飲します。WEBではこのミネラルサイトで数十羽のアオバトが飛来し吸飲する様子もアップされていますが、この日の半日の観察では同時に2、3羽が飲んでいるだけでした。ミネラルサイトを擁する小山と対岸の杉の小山の間をひっきりなしにアオバトが飛んでいきます。このミネラルサイトの小山に入るアオバトの数は多いもののその全部がミネラルサイトに降り立って飲んでいるようには思えませんでした。 目的の一つである湧き水採取のため変色したコンクリの下までいきました。変色した法面全体から水が滴り落ちて水たまりになっていました。そこで50mlぐらい水を採取。口に含んで見るとかなり塩味を感じました。もちろん海水ほど塩辛くはないのですが、塩を水に薄く溶かした感じです。薄めの味噌汁やスポーツ飲料よりも薄い。でも山の中でこの塩味は相当な濃度だと思われます。 アブの攻撃をかわしながら採取した水は成分分析をお願いするつもりです。 ...

飛び地で鳴くウグイス

面白いウグイスの声を聞きました。ひと月前ぐらいから鳴いているとのこと。 ヒーホトチトとか聞こえます。 まあ聞いてみてください。 https://www.xeno-canto.org/419699 2つ目と4つ目の声の後にポポッポポと聞こえる声がありますが、これもこのウグイスちゃんの声です。目視で確認しました。 聞いた場所のお屋敷は鬱蒼としたお庭なのですが、この辺りは大きな森はなく飛び地的な緑です。 会社にも飛び地的な小さな林があり、この5月にウグイスの声を何度か聞いています。このウグイスも少し変な声でした。周辺部の林で鳴くウグイスは変な声? それと、子育てもできているのでしょうか? 里山の広い面積の森の一等地で鳴くウグイスと飛び地で鳴くウグイス、メスに出会う頻度は相当違うでしょう。 オスのウグイスは鳴くばっかで子育てに参加せず、複数のメスに言い寄る一雄多雌の配偶様式ですが、メスも繁殖のたびにパートナーを変えます。 飛び地に来るメスが果たしているのか、森では3月からガンガンオス達の縄張り争いが起きているのみ、それから2ヶ月も遅れて飛地に現れ、鳴き続けるオス。このオスの正体はいかに!? 身近な自然でも謎は尽きません。 こんなことを考えて聞いてました。

HDDでTimeMachinはどう考えればいいんだろう

自動録音を毎晩12時間を毎日続けている。 129kbps~196kbpsで約600MB/ファイルになる。 これを1時間ごとに分割して、それを声紋分析用にWAV形式で保存すると半年で1.4TBにもなることがわかった。 半年のデータは貴重だ。 で、バックアップをどうするのかを考えた。 方法はRAID1で別ファイルにするか、TimeMachineの対象にするのか。ならTimeMachineでいいかと思えるのだ。 というわけで20TBを選ぼうと思う。

高速フーリエ変換fftwの係数

フーリエ変換は信号処理に欠かせない。 フリーの高速フーリエ変換として fftw が有名である。しかしその係数についてパッと検索しただけではわからなかったので自分で調べてみた。 Mathematica には係数を明示的に定義できる。 FourierParameters->{a,b}の設定で,Fourierにより計算される離散フーリエ変換は   1/n^((1-a)/2)Underoverscript[\[Sum], r=1, n]Subscript[u, r] e^(2\[Pi] ib(r-1)(s-1)/n) となる. » よく使われる{a,b}の選択として, {0,1} (デフォルト), {-1,1} (データ解析), {1,-1} (信号処理) がある. In[1]:= data = {1, 0, -1, 0, 2, 0, -2} In[2]:= Fourier[data, FourierParameters -> {1,-1} ] //   TableForm Out[2]= 0. +0. I -1.8264+0.279032 I 3.59299 -3.9474 I 1.73341 +0.300257 I 1.73341 -0.300257 I 3.59299 +3.9474 I -1.8264-0.279032 I 他方、Rでは library("fftw", lib.loc="/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.3/Resources/library") data=c(1, 0, -1, 0, 2, 0, -2); fft(data) [1]  0.000000+0.000000i -1.826396+0.279032i  3.592990-3.947403i [4]  1.733406+0.300257i  1.733406-0.300257i  3.592990+3.947403i [7] -1.826396-0.279032i と同じになりました。これはMathematicaの説明ではデータ解析で全体の係数は 1、Expの係数は-2π ですね。ここでもう一つわかるの...

本人が楽しんでこその科学が最高 読書感想

チョー面白かった。 出だしの科研費獲得の書き出しには面食らったが、その後は快調に著者の筆運びを楽しむことができた。読んでいてワクワクした。 少し前に読んだ "乱交の生物学 2003 ティム バークヘッド著‎"で性的葛藤と精子競争の知識を下敷きとして持っていたが、その説明は圧倒的に本書の方がわかりやすい(4章、5 章)。 でも一番面白いのは、著者による虫の生態に迫る研究の方法と結果だ。例えば、モンカゲロウの調査の話が出てくる。オスが春の夕方、群れで飛びメスをいかに獲得し他のオス を排除しながら産卵に至らせるのかを調べた調査である。その調査きっかけは長い触覚のオスを見つけ、実はそれは長い前足だと気がつきFaceBookにアップして昆虫仲間との やり取りから始まる。オスだけに見られる長い前足は性選択の産物であることに気づき、研究仲間の誰もが交尾姿を見たことがないことに発奮し観察を続けると、昼行性のツバ メや夜行性のコウモリに食べられないほんの30分の間に交尾できた個体だけが次の世代を残せることを突き止める。そしてその交尾のタイミングは概日リズム(体内時計)の進 化の結果であり、深刻な害虫であるミバエの根絶のための不妊オスの飼育の交尾タイミングの課題へと話題は広がっていく。 面白い。 本書で学んだのは、虫たちの性戦略の奥深さだけでなく、個々の個体の個性の発揮と研究者自身が楽しむことの大切さであった。久しぶりに知的興奮を覚えた。

今年最後のバードウオッティング(冬鳥の地鳴きの意味を考える)

   今朝は暗いうちから今年最後の地元で鳥見です。 一箇所でじっとして聞く”聴き耳”でなく、ブラブラ録音歩きです。 森の小川の上流の堰から上をゆっくり歩きました。夜明け前に堰に付き、獅子座を真正面に見ながら鳥が鳴き出すのを待ちました。 今日は意外にもメジロの鳴き出しが遅い。一番鶏は種名不明ながら”ギャー”と藪の中からの声でした。その声はガビチョウが近いです。 ソウシチョウの声もしました。群でなく単独で。 アオゲラ♂がヌルデ?の実を食べながら長く”キョキョキョ”と鳴いています。シロハラも来ました。ピャピャピャって鳴いたりして。 ウグイス(少し大きいので♂?)がアオキの上に出て盛んに”チャ、チャ、”と鳴いています。声に気がつき、30mまで近づいての観察でしが このウグイスは上を随分気にしていました。一瞬20cmぐらいジャンプして空中の何かを咥えたように見えました。 今日は寒いながら小さな虫が飛んでいたので、虫を捕まえたのかもしれません。やるなー。 エナガとメジロ、ヤマガラ、シジュウカラなどの混群に2回出会いました。出会うと賑やかです。 いま、石塚徹さんの本(歌う鳥のキモチ)を1行1行慈しむように読んでいますが、 それに倣って”目の前のこの鳥はなぜ声を出しているんだろう?”と考えて鳥を見るようにしました。 今日の気づきです。 エナガを中心とする混群は賑やかに移動していきます。 それに比べて、単独かペア、少数のウグイスやミソサザイ、クロジ、アオジはいつも鳴いているわけでなく鳴いても短い。 その違いは、群を構成する者たちは群るために声を出し合って、互いの位置を確認しているに違いありません。 食べ物探しに熱中して遅れをとると複数の目がないことから被食の危険性が高まるのかもしれません。 声を出さない餌探しはそんな危険がありますから石塚さん流に言えば 「群にあっても声を出さない個体は、長い進化の時間の中で生存に不利に働きその形質は淘汰される」でしょう。 それに比べて単独とか少数で過ごす森の鳥たちは、頭上の捕食者に見つからない藪の中が好きです。ヒタキは別のようですが。 冬は蛇もいないだろうし、他の哺乳動物(イタチ、テン、猫なんか)に昼間被食される可能性はどのくらいあるのでしょう。 彼らは夜行性が...

MacBook Pro Retina Late 2013 のSSD換装

いよいよ、McBook Proのメモリ容量が無くなってきた。 拡張性も高く、速度も気に入っているMacBook Pro Retina 2013。でもメールの添付ファイルや、重いアプリを入れているので内蔵SSDを圧迫している。音声データや写真は全て外付けHDD(4TB)に入れて持ち歩いている。 iPhoneも7に変えたので、126GBの内蔵メモリを使いこなしていないこともあるし。 そこで眼をつけたのが、今年やっと出た拡張SSDモデル。ヨドバシよりやはりアマゾンの方が安い。この週末、データを入れ替えてみるか。

夏日の日、里山は夏鳥の声にあふれて

今日も近所の里山に鳥の声を聴きに行ってきました。 思いの外面白かったです。ファイルはxenoにアップロードしました。 夜明け前の暗い時間帯は谷戸で鳴き出しを聞きました。 03:50 つくと谷戸ではヒクイナの声がしました。録音しようと思ったら黙っちゃった。ドアの音に驚いたかな。 04:03 キビタキが今朝も一番ドリです。静かに小声でオハヨーって囀り出しています。でもカエルは夜中鳴いているんです。 04:17 ジュウイチがゆっくり鳴きながら飛んで行きます。 http://www.xeno-canto.org/371156 森を流れる川に移動しました。 04:36 ガビチョウが絶好調で囀っています。ポピチョー、ポピチョー、ジュゲムジュゲムお経上げてるみたいです。 その後、オオルリ、キビタキ、ヤブサメ、サンコウチョウ、クロツグミ?が聞こえました。 ・ヤブサメは2カ所で3羽以上いたでしょう。繁殖しているのかもしれません。かなり早口のヤブサメもいます。  面白い事に気が付きました。ソナグラムで見ると、ヤブサメは最高強度の周波数が7.2KHzから8.5KHzまでシシシシと声が上がって行きますが、最初の出だしは林の自分の回り全体から聞こえて、声が高くなるに従って目の前に位置を同定できるようになります。1KHzの差ですが、森は反射の具合が大きく違う様です。冬鳥の地鳴きは位置が特定できにくいのですが、そんな周波数を使っているんでしょう。 http://www.xeno-canto.org/371137 ・サンコウチョウは尾の長いオスと尾の短い雄を見ました。追っかけっこしているのも見ました。今がナワバリ形成かな?  尾の短い雄は崩落面の辺りから広場まで移動していました。尾の長い雄は上流の堰辺りにいました。雄は3タイプあると今日知りました。 http://www.bird-research.jp/1_event/aid/img/BR-aid2013006.pdf   http://www.xeno-canto.org/371139 ・ハシブトガラスが2羽、ア”ーア”ーという甘え鳴きをして嘴を触れ合っていました。恋の季節なのでしょう。 ・アオバト 6:48、6:58に鳴きました...

鳴き声からの識別(How to identify the bird from its sound. )

鳥はその暮らしの中で様々な音を出します。 朗々と鳴く囀り、冬の地鳴き、飛ぶ時の羽音、何かを突っつく時の音、翼を体にぶつけて出す母衣(ほろ)うち、虫を探しているのか枯葉をひっくり返すときにでるカサコソと言う音。その中にあって、自己を主張しコミュニケーションとしての囀りや地鳴きの声は鳥の名前を探り当てる大いなる情報です。 鳥の鳴き声を聞いて、なんて言う鳥が鳴いているんだろう、とバードウォッチングの最中に思う事はしょっちゅうです。ベテランのバードウォッチャーはこの声は○○と教えてくれます。では、聞く相手も居ないとき、バードウォッチングしている仲間の誰も分からないとき、鳥の声からどう鳥の種名を探り当てる事ができるでしょうか。このページではそんな事を考察したいと思います。 参考にするレファレンスCDはこの4冊:蒲谷1996(蒲谷2004)、上田1998、松田2016、植田2014、このページの下にリンクを張りました。この他にも、 バードリサーチ鳴き声図鑑 もあります。 xeno-canto も有名です。 それでは、鳥の鳴き声から種名同定までの幾つかの方法を見て行きましょう。 初級編 方法1)探鳥会で人に聞く 当たり前ですが、知っている人に聞くのが一番手っ取り早いです。 バードウォッチングの初心者は見るモノ聞くモノすべて新鮮で教えてくれる人もたくさんいます。探鳥会に参加してその場所で年中見られる普通種をまず覚える事になります。これが”ものさし”となってこれと同じか違うかが分かれば、聞き分けられる数が多くなってきます。 方法2)さえずりナビを試す。 バードリサーチが”さえずりナビ”をスマートフォン向けに作っています。 家の周りで,ハイキングに行ったとき,鳴いている鳥の種名を知りたくなることがあります.「さえずりナビ」は,場所・季節・声のタイプなどから,その鳴き声の鳥を検索してくれます.姿や形の専門知識が無くても検索ができ,その鳴き声を聞くことができます. あまり使った事無いのですが、twitterではまあまあのコメントが多いです。 中級編 方法3)録音して似ている声をCD/WEBで調べる 録音できれば後で調べる事ができます。ICレコーダも小さく安くなってきました。持っていなくても携帯電話やコンパクトカメラの動画機能でとりあ...

鳥の関連情報

野鳥誌の書評に載っていたこの本「 「幻の鳥」オオトラツグミはキョローンと鳴く (フィールドの生物学) 」、これは読まないといけないでしょう。奄美大島で一度は聞きたいと思っている鳥です。   そして、松田さんの新作「鳴き声から調べる野鳥図鑑」。こちらもGW前にGETだぜ。

カッパの修理 単4電池(エネループ)

ゴアテックスのカッパも時間とともに痛む。 外側ならともかく、内側がボロボロと来た。 そんなら、こん位でいいでしょう。300円ぐらいだし。 買って補修したら報告します。 で、単4電池(eneloop)も時間とともにへたって来た。今度は大容量タイプにしみてみよう。

声紋・ソノグラム・スペクトルグラム

声紋(sonogram, spectrogram)は野鳥の声の分析に不可欠なツールです。横軸に時間、縦軸に周波数を取って、音の強さを色で表示します。 ここで用いられている処理は、音声である波形を周波数の信号に変換する時間−周波数変換(フーリエ変換)です。フーリエ変換するときに幾つかの調整できるパラメータがありそれぞれがどう関係しているのかをまとめてみました。案外、まとめて書かれているものがありません。そのため自分で調べました。厳密に定義しているのではなく備忘録です。初心者向けにコ ーネル大学の作成したCanary/Ravenのマニュアルの付録に鳥の声のスペクトル解析の章 がありこれを参考にしています[1]。 音声データのパラメータ 波形とは時間に対する強度が連続的に変化する信号を表します。音声は波形であり、ICレコーダは連続の波形を離散化(デジタル化)されて記録されます。離散化された信号も波形と呼びまし、今はディジタル信号を意味する事が多いです。 連続な信号をとびとびの信号で表すので失われる情報があります。しかし、必要とする周波数帯域の2倍以上でサンプリングレート(サンプリング周波数)で離散化すれば完全に復元できるとシャノンさんが証明しました。 この関係は、次の表のようになります。 サンプリングレート(SR) 標本点の周期(ΔT) 192KHz 5.2μs 96KHz 10.42μs 48KHz 20.83μs 44.1KHz 22.67μs 音を声紋(スペクトログラム)にするには短い一定期間の波形データを切り出して(スライス)これを周波数変換し並べます。この短時間の周波数変換を短時間フーリエ変換:STFT(Short Time Fourier Transform)と呼びます。問題はこの時間の選び方です。時間と言っても離散化されているのでその切り出す波形の個数です。切り出された波形をフレームと呼んだりチャンクと呼んだりします。ここではフレームと呼びます。1フレームの波形の個数をフレーム長(Flame Length)と呼びます。各アプリではもっとわかりやすい言葉を使っていますが同じ意味です。 Amadeus Pro : FFT Size Audacity : ウィンドウサイズ 鳥の...

鳥の鳴き声大図鑑(Birder 2017年04月号)を読んで

鳥の鳴き声大図鑑(Birder 2017年04月号)を読んで   最近、本やCDなどレガシーメディアでの鳥の声の情報が増えている。うれしい事だ。これらはきちんと監修されているので信頼に足る事が最大の長所。短所はネット情報に比べて、掛かるコストが高い事だが、監修と信頼がその値段だと思っている。 楽しみにしていた本号であり、書評を若干。 全体を通して前半の記事は特集の意図を汲むものだが、後半の記事はテーマの選び方が散漫な印象。初心者〜ベテランまでバードウォッチャーが本当に知りたい、”知らない声を聞いたんだけど、それは何かどう調べたら良いんだろう”などの疑問には明快には答えてくれない。それでも鳥の声の第一人者で日本野鳥の会理事の松田さんの総論と、25種の解説は知らない事も多く一読の価値がある。また、鳴き声に文法を持つシジュウカラの最新研究はバードウォチャーは必須の知識でもある。 特集のみにフォーカスする。 8個の記事と1つのコラムからなり、特集の説明は「鳥が見つからない原因の80%は鳴き声を知らないからだ!」なので、初心者を意識したものだろう。そのため、最初の記事は松田道生さんに依る「野鳥観察に鳥の声が重要な理由」がうまくまとめられている。鳥は声で見つけるが、日本語に置き換えにくくそのため覚えにくいこと、分からない事も多いが地鳴きは鳥の気持ちを表し、鳥の気持ちがわかるバードウォッチングができるなんて考えると楽しくなると締める。 その後、覚えておきたい25種の鳥の声の解説がある。1番のヒヨドリから、シジュウカラ、カワラヒワ、など25番のアオバヅクまで続く。それぞれの解説には短いながら”おお、そうなんだ”と松田さんならではの説明がある。中でも気になったのはヒヨドリの地鳴きとさえずりがはっきりしないこと、コゲラのドラミングは10分以上続けうること。また、キジバトのデデポポはさえずりとして取り扱っている点も興味深い。ハトのさえずりについてナワバリ宣言の機能もあるのかなどもっと伺ってみたい。 梅垣佑介さんによる「鳥を見える化するソナグラムの活用」は最も期待していた記事だ。記事ではソナグラムを用いた識別の例としてニシオジロビタキとオジロビタキの震える声(トリル)の違い、エゾムシクイとアムールムシクイの声の高さの違いを挙げて種識別できると説明し...

サンショウクイの亜種同定に挑戦

今日(2017-03-17)、サンショウクイの声を聞いた。 この冬中、この近辺に居た亜種リュウキュウサンショウクイかと思ったが、ひょっとして亜種サンショウクイが渡って来たのかもしれない。 今日聞いたサンショウクイの声はこちら→ ♪ 。高速道路の脇でたまたま録音できたが雑音が激しい。低音をカットしてノイズ除去してみた。 3月中旬と渡りには早いと思われる。時期的に微妙なので、三上2016による判定を行った。詳しくは こちら 。 第3音節の解析 もとめるのは6つの音声要素パラメータ。   a : 先頭の周波数,   b : 第一音素の最高周波数,   c : 最高周波数,   d : 最後の音素の最高周波数,   e : 節 の長さ,   f : 最大音圧の周波数, これらを声紋と音節全体のスペクトルでfを求めた。用いたのはAmadeusProVer.2.3.1を使用。FFTサイズは512ポイント。 ヒリリリを一つの音節とすると第1音節は途中から始まるのでNG、第2−4を分析すると次のようになった。声紋の音圧を示す色から最大値を読取った。三上(2016)に依ると判定値が正なら亜種リュウキュウサンショウクイの可能性が高く、負なら亜種サンショウクイの可能性が高い。 判定結果:   # a b c d e f 判定値 第2音節 5156 5453 5703 5640 311 5587 0.23667 第3音節 4859 5281 5620 5468 331 5423 -0.28205 第4音節 5015 5226 5778 5625 540 5383 0.00429 (単位:eはms、それ以外はHz) 微妙な判定値だ。 b-dは-187, -187, -399(Hz) でどれも負。しかし、音の高さ(f)は5500Hz前後で亜種リュウキュウサンショウクイの分布に重なる。 さーてどっちでしょう。 <2017−03−20> リュウキュウサンショウクイでいいようです。三上さんに確認して頂きました。ありがとうございます。以下も参考になるとか。 亜種リュウキュウサンショ...